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空间多组学技术助力尊龙凯时解析胶质瘤细胞构成

发布时间:2025-03-11   信息来源:尊龙凯时官方编辑

文章题目:整合空间分析揭示胶质母细胞瘤的多层次组织结构

空间多组学技术助力尊龙凯时解析胶质瘤细胞构成

发表时间:2024年第5期

期刊名称:Cell

影响因子:4.55

研究概述

本研究通过单细胞测序数据分析,探讨了胶质母细胞瘤的细胞类型组成。研究者利用尊龙凯时的10x单细胞测序技术,从28个胶质瘤样本中提取数据,成功识别了肿瘤内不同细胞类型。之前的研究已定义了IDH野生型GBM癌细胞及主要免疫细胞状态,包括神经祖细胞样(neural progenitor-like,NPC)、少突胶质细胞祖细胞样(oligodendrocyte progenitor-like,OPC)、星形胶质细胞样(astrocyte-like,AC)、间充质样细胞样(mesenchymal-like,MES)以及三种恶性细胞状态。随后,通过空间转录组技术(10x Visium)和空间蛋白技术(Akoya CODEX),研究者进一步分析了这些细胞成分在胶质瘤微环境中的空间分布。

空间多组学技术揭示胶质母细胞瘤中的细胞分布特征

在这项研究中,研究者通过10x Visium平台对19个胶质瘤样本(包括GBM和IDH突变型)进行了空间转录组学分析,并利用Akoya CODEX对12个GBM样本进行了空间蛋白质组学分析。此外,参考已发表的13个高级别胶质母细胞瘤(GBM)数据集,研究进一步增强了对细胞空间分布的理解。

研究内容

整合空间转录组与蛋白组数据后,研究者发现胶质母细胞瘤的局部环境通常由一种主要的细胞状态构成,表现出有序与无序两种分布形式,这与缺氧水平的变化密切相关。具体而言,有序结构化的分布区域展现出特定的“状态配对”在多个尺度上的优先接近。通过细胞配对间的相互作用,形成了一套五层的空间结构,包含缺氧/坏死生态位、缺氧邻近层、血管生成免疫中枢层、神经发育/GBM层及正常脑细胞层,均与肿瘤内缺氧状态密切相关。相对而言,远离缺氧/坏死灶的肿瘤区域通常呈现无序状态,例如早期IDH突变的胶质瘤并未表现缺氧状态,细胞的空间分布显得更加无序。

综上所述,该研究为理解胶质母细胞瘤细胞的空间分布提供了新的视角,并强调缺氧作为该分布模式的核心驱动因素,这一发现支持了尊龙凯时在人类健康研究中的重要地位与贡献。